بررسي و تهيه سياست‌هاي كلان در چارچوب وظايف مصوب با مشاركت واحدهاي تابعه و پيشنهاد به مراجع ذيربط جهت تصويب.
تهيه، تنظيم و تلفيق برنامه هاي كوتاه مدت، ميان مدت و بلند مدت در چارچوب برنامههاي جامع توسعه بخش كشاورزي.
دريافت پيشنهادات برنامه‌اي سازمان و تلفيق آن در چارچوب برنامههاي كلان وزارت متبوع.
تهيه اولويت‌هاي بودجه ساليانه سازمان براساس راهبردها و رويكردهاي وزارت متبوع و ابلاغ آن به واحدهاي تابعه.
تهيه، تدوين و پيشنهاد خط‌مشي‌ها، سياست‌هاي بودجه‌اي در قالب اعتبارات ساليانه سازمان با هماهنگي و همكاري واحدهاي ستادي.
دريافت، بررسي و تجزيه و تحليل بودجه پيشنهادي واحدهاي سازماني براساس برنامه هاي مصوب و ارايه آن به مراجع ذيصلاح و پيگيري تا مرحله تصويب.
برآورد اعتبارات مورد نياز برنامه هاي مختلف سازمان اعم از اعتبارات هزينه‌اي، تملك دارائيهاي سرمايه‌اي، درآمدي و تسهيلات بانكي و ساير منابع اعتباري به تفكيك واحدهاي ستادي.
بررسي، تهيه و تنظيم پيش نويس موافقت نامه هاي سازمان با همكاري واحدهاي ستادي به منظور ارايه به مراجع ذيربط جهت تصويب.
تهيه و تنظيم برنامه هاي ميان مدت و بلند مدت به منظور نيل به توسعه پايدار و همه جانبه دربخش حفظ نباتات به صورت ملي، منطقهاي و استاني
فعاليت در زمينه اعمال تغييرات مورد نياز در زيربخشهاي اعتباري و برنامه اي در جهت همسو كردن طرحها و برنامهها با اهداف تعيين شده در برنامههاي ميان مدت و بلند مدت
پيگيري تصويب موافقت نامه ها در مراجع ذيصلاح با مشاركت ساير واحدهاي ستادي سازمان و واحدهاي مرتبط در وزارت متبوع.
ابلاغ موافقت‌نامههاي مصوب عمليات طرح‌هاي تملك دارائيهاي سرمايه‌اي، هزينه‌اي ودرآمديبه واحدها.
ابلاغ بودجه مصوب واحدهاي ستادي بر اساس برنامه هاي تعيين شده.
درخواست و اخذ تخصيص اعتبارات تملك و دارايي‌هاي سرمايه‌اي و هزينه‌اي از مراجع ذيربط.
تهيه جدول توزيع اعتبارات قابل تخصيص و ابلاغ آن به واحدهاي ستادي سازمان.
نظارت بر مصرف و هزينهكرد اعتبارات ابلاغي به واحدهاي خارج ازمركز و استاني و ستادي در جهت مطابقت آنها بر برنامههاي مصوب ارائه شده از ساير دستگاههاي مرتبط با حفظ نباتات
بررسي و پيشنهاد قوانين، مقررات، آيين‌نامه‌ها و تبصره‌هاي قانون بودجه سالانه (تملك هزينه و درآمد) با مشاركت واحدهاي تابعه.
تهيه و تنظيم دستور العمل‌ها و ضوابط و مقررات مورد نياز جهت جذب اعتبارات وتسهيلات بانكي مورد نياز طرحها و برنامههاي مصوب سازمان و نظارت بر حسن اجراي آنها.
نظارت و گزارش‌گيري از پيشرفت فيزيكي طرحها و مصرف اعتبارات اعم از (تملك دارايي هاي سرمايه‌اي، هزينه‌اي و درآمدي و تسهيلات بانكي) با همكاري و هماهنگي واحدهاي ستادي سازمان و واحدهاي استاني
نظارت برحسن اجراي برنامهها و براساس شاخص‌هاي عملياتي در قالب بودجه ساليانه سازمان.
شناسايي منابع تامين اعتبار جديد، مرتبط با وظايف سازمان